医药书籍占《道藏》内容的百分之七十以上，包括医经、养生、气功、内丹、方剂、养性等各类文献近千种。其中有些医书属于孤本、珍本、秘本而仅存于《道藏》中。1针灸作为中医学的一部分，同样受到了道教思想的深刻影响。因此，深入研究《道藏》，不仅对针灸理论的挖掘和发展有重要意义，亦可为针灸临床提供指导。
《内经》一、《素问》在王冰注解中，更是精辟地阐述了病机与治疗方法，如“刺热”、“刺疟”、“风论”、“痹论”、“痿论”等篇，都运用了经脉学说来解释其发病机理，使后世医家能更好地理解和应用。
广征博引，汇存文献王冰注解除了参考了《甲乙经》，还引用了《针经》、《经脉流注孔穴图经》、《真骨》、《黄帝中诰孔穴图经》，将《素问》的腧容相结合，从而保留了部分今已失传的腧穴，使得腧容趋于完善。
独到阐释，拓展医理在纠正错误取穴法方面，如“天突在喉结下五寸”，王冰则提出：“天突在颈结喉下，同身寸之四寸”，中央宛宛中，是任脉之会，这对于提高针灸临床效果起到了促进作用。在治神方面，“专其精神，以期无”，强调术者应专心致志，不要分心；在候气方面，“审其病藏，以期其气而刺之”，要求术者先观察患者体质，然后根据气象变化进行治疗；在补泻方面，“先补后泻”的原则，为临床实践指明方向。
二、《灵枢》
该书尤重视针灸，因此第一篇即强调“先立针经”。涉及到的内容丰富且精深，对于讲述了各种取穴法、中药配伍以及其他相关知识，为后世发展奠定坚实基础。此外，该书采用黄帝与岐伯问答的形式，与其他著作相互参对，再行校正，使得整部作品更加准确和详尽。
三、《难經》
该书虽非针灸专著，但却对此领域做出了重大贡献，在十二经脉理论上有所补充，并首次提出了八会穴，将奇經八脈學說推向更高層次。此外，该書對於取穴法與針刺方法也有獨特見解，並對初學者具有重要指導意義。
四、《太平經》
該書既是一部醫學著作，也是早期道教主要經典之一，其論述內容與內經略有不同，這為研究古代經絡學說提供了一定的參考價值。此外，该書還強調針刺與熏蒜療效良好的結合，以及兩者的應用技巧，有助於我們對這兩種療法有更多了解。
五，《肘後方》
該書保存了一些較為豐富的地熱療法資料，如隔物熏蒜全書載有隔盐、隔蒜等多種熏蒜方式，此類創新的療法至今仍有人使用或被人啟發。
六，《千金要方》
該書發展並考訂了十二經五輸腑の流動路徑，並記錄下349個點位，用文字描述許多需要注意的地方，其中包含48個單點位和301個雙點位，它們對於準確選擇針壓位置非常實用。此外，它也介紹許多奇異腑位，以及鬼腑腑名具體化處置範圍及其適應證據。
