丘处机，登州栖霞出身，以长春子为号。童年时，有相者预言他将来成为神仙宗伯。十九岁那年，他在宁海的昆仑山学习全真道，与马钰、谭处端、刘处玄、王处一、郝大通、孙不二一同师从重阳王真人。重阳一见到丘处机，就认定他是大器久远。在金宋之际，都派使者前来招募他，但他都没有应征。
到了己卯年，太祖亲自下令近臣札八儿和刘仲禄持诏书去寻找丘处机。他突然对他的弟子们说：“天使已经来召我，我要去。”第二天，他们二人就来了，丘处机带着十八名弟子一起前往了太祖那里。次年，他留在山北，对太祖表示谢意，并劝说不要杀生。这之后，又有两次求召，他都拒绝了，然后发兵到抚州，经过数十个国家，为地面积达万余里。他历经四载的艰难跋涉才抵达雪山。在深雪中行走时，他常常骑马试验雪质，只要没积满半截就开始前进。一到目的地，太祖非常高兴，对他进行了盛宴接待。
当时太祖正忙于西征，每日攻战无休止，而丘处机总是强调“不嗜杀人”才能天下，这就是治国之道。而对于长生久视之术，他则告以“清心寡欲为要”。太祖深受其影响，说：“天赐仙翁，以醒朕心。”于是授予虎符并副以玺书，不提及名字，只称呼“神仙”。有一次雷鸣响起，太祖询问原因，丘处机回答：“雷，是天威警示人的罪过。不孝的人违背了自然法则，因此遭到了雷震。我听闻境内不孝之人众多，你应该借此机会纠正他们。” 太祖照办了。
在癸未年的东山猎狩中，当马匹跌倒时，丘處機请求停止狩猎，因为“天道好生”，而且皇帝春秋已高，不宜再继续狩猎活动。这项建议得到了采纳，从此以后，大规模的战争导致河南北地区严重破坏，无辜民众遭受苦难，没有地方可逃。当人们回到燕京后，由于他的努力，一些奴隶得以重新自由生活，而那些濒死的人也得救活，大约有二三万人获益良多。此事至今仍被河南人民传颂。
乙酉年间，当荧惑星体靠近尾部时，它的占星结果表明这将会发生在燕京，那时候丘處機祈求它离开，最终果然如此。当又一次旱灾发生时，他通过祷告请求雨水降临，并保证三日内就会出现雨景，最终确实如期实现，而且还引起了一系列瑞兆事件。随后皇帝命令改变宫殿名称为长春宫，并派遣使者劳军，同时颁布诏书曰：“朕常思念神仙，而神仙不可忘记朕。”
六月的一次浴池事故，在东溪洗澡两天后，却遭遇暴风雨，使得池塘干涸而北岸崩塌。面对这种情况，位于池塘旁边的声音传出几里的距离，让鱼鳖尽毁而池塘完全干涸。这让大家惊叹世间变化巨大，如同摧枯拉花般迅速。而同时，也有人感慨吾等亦将与其共存亡！遂卒于此刻，全寿八十岁，其门徒尹志平等继承遗志，将教义发展下去直至大安元年，被追赠金印作为最高荣誉。(选自《元史·卷二百二·列传第八十九》)
